ولد محمد شجاعي عام 1343 في عائلة دينية ومتدينة في مدينة الري وأكمل تعليمه الابتدائي والثانوي في نفس المدينة. بعد أن أكمل تعليمه الثانوي ، بسبب شغفه الكبير بالعلوم الدينية ، التحق بالحوزة ودرس لسنوات تحت إشراف سيد الإكليريكية البارز ، آية الله مجتهدى طهراني.

كما استفاد باستمرار من علماء بارزين مثل العلامة حسن زاده أمولي ، وآية الله جوادي آمولي ، وآية الله أنصاري شيرازي ، وآية الله ممدوحي ، الذي كان من تلاميذ المرحوم آية الله بهجت ، والحاج آغا إمامي ، والراحل السيد دولابي. رتبة الاجتهاد في الفقه الإسلامي.

استفاد الأستاذ محمد شجاعي من حضور أساتذة العلوم اللاهوتية البارزين في الجامعة أيضًا بإكماله درجة البكالوريوس في الفلسفة والماجستير في علوم القرآن ، مما عزز الأسس المنطقية لتعلمه واقترب تدريجيًا. أقرب إلى طريقته الخاصة في التعبير.